Caractérisation génétique des Zostera noltii de l'étang de Berre, Genetic characterization of Zostera noltii in the Berre Lagoon
Les herbiers de Zostera noltii sont en régression continue dans l’étang de Berre. Malgré la réduction drastique des rejets polluants industriels, la mise en conformité des systèmes d’assainissement et la limitation des apports d'eau douce et de limons de la Durance, la régression des herbiers de Zostera s'est poursuivie, passant d’une surface de 6000 ha au début du 20ème siècle, à moins de 2 ha actuellement. Les ceintures continues d'herbier ont laissé la place à des taches reliques, de taille métrique à décamétrique, cantonnées à quelques secteurs de l'étang, principalement le long de la face est du Grand Etang, éloignées de la connection avec la mer ouverte et les vastes herbiers du Golfe de Fos.
Il est reconnu que l’isolement géographique des herbiers les rend plus vulnérables aux changements des conditions environnementales, par l’augmentation de la consanguinité (auto-fécondation) et par le faible apport externe de formes alléliques nouvelles.
L’objectif de cette étude est de caractériser l’isolement et le polymorphisme génétique des populations de Zostera de l’étang de Berre. Les résultats permettront d’évaluer le niveau de la ressource génétique et aideront à définir les mesures de gestion appropriées.
Un minimum de 40 faisceaux ont été échantillonnés dans deux herbiers de l’étang de Berre (Arc, Pointe de Berre), ainsi que dans l’anse de Carteau (Golfe de Fos) et dans la lagune du Brusc (Var). Les génotypes individuels ont été obtenus au moyen de marqueurs de l’ADN (9 microsatellites-loci) et ont été comparés à ceux de trois autres herbiers de Zostera noltii de la côte Tyrrhénienne italienne.
Les herbiers de l’étang de Berre apparaissent très isolés des herbiers de la mer ouverte (golfe de Fos, lagune du Brusc) et une structure génétique claire est observée le long d’un gradient géographique allant du sud de la mer Tyrrhénienne à l’étang de Berre. Les résultats montrent également une forte hétérozygotie, dans l’ensemble des populations étudiées, ce qui témoigne d’une reproduction sexuée active et d’un faible taux de consanguinité au sein de chacune des populations
Au sein de l’étang de Berre, les deux populations de l’Arc et de la Pointe de Berre sont en relation, avec une proportion (faible) de génotypes communs. Cependant, un nombre d’allèles inférieur et un niveau de diversité génétique plus faible est observé dans la population de l’Arc, ce qui peut avoir des conséquences sur la persistance de cet herbier.
Gabriele PROCACCINI1, SERRA I.2, BERNARD G.3
1 Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa communale, 80121 Napoli, Italy
2 Dipartimento di Ecologia, Università della Calabria, (CS) Italy
3 GIPREB, France
En vidéo :
Première partie
Deuxième partie