Suivi de la dynamique haute fréquence des assemblages phytoplanctoniques .
L’objectif général de ce travail de recherche est la caractérisation de la dynamique spatio-temporelle des assemblages phytoplanctoniques, à travers un suivi à haute fréquence temporelle et à l’échelle individuelle par cytométrie en flux. La mise en évidence de groupes fonctionnels de réponse, définis par des cellules réagissant de manière identique aux forçages naturels ou anthropiques, est une étape majeure de ce travail. L’étude in situ est réalisée dans l’Etang de Berre, une zone soumise à une forte pression anthropique ainsi qu’à des forçages naturels importants comme par exemple le régime des vents (coups de Mistral ou vent d’Est). Pour appréhender la réponse de ces micro-organismes aux facteurs de contrôle, il est nécessaire de se placer à des échelles de temps et d’espace adéquates et de coupler les données sur la biologie avec des variables environnementales (hydrologiques, météorologiques).
Une approche d’analyse automatisée et à haute fréquence temporelle du phytoplancton sera privilégiée par l’utilisation de cytomètres autonomes du type Cytosense (version de paillasse avec prise d’images) et Cytosub (version immergeable ; www.cytobuoy.com). L’analyse automatisée des échantillons par l’instrument sera couplée à une analyse automatisée de données. Elle permettra la discrimination des abondances des différents groupes définis d’après leurs profils optique de diffusion de la lumière et leurs profils optiques de fluorescence (fluorescence induite par une sonde ou naturelle : cas de l’autofluorescence du phytoplancton). Un des aspects important de ce travail est le développement de méthodes d’analyse de données fonctionnelles* et de classification, ce qui permettra in fine de discriminer automatiquement et objectivement les groupes d’intérêt. *Chaque individu analysé par l’instrument est défini selon cinq profils optiques, c'est-à dire par cinq fonctions en relation avec la taille, la forme, et les propriétés optiques de fluorescence.
Anthony MALKASSIAN
UMR CNRS 6117 / LMGEM
Université de la Méditerranée (Aix-Marseille II)
Centre d'Océanologie de Marseille
163 avenue de Luminy, Case 901, Bât TPR1 F
13288 Marseille Cedex 9, FRANCE
En vidéo :
Première partie
Deuxième partie